Regeneracja czasowa polega na inicjowaniu procesu w stałych, z góry zaprogramowanych odstępach dniowych. Głowica pracująca w trybie czasowym automatyzuje procesy uzdatniania wody, inicjując regenerację lub płukania złoża w wyznaczonym czasie. Harmonogram płukań ustawiany jest w urządzeniu, jakim jest sterownik czasowy, ustalając moment rozpoczęcia regeneracji.

Technik serwisu nie dobiera czasu regeneracji przypadkowo. Częstotliwość regeneracji wynika z precyzyjnych obliczeń projektowych, w oparciu o analizę fizykochemiczną wody surowej oraz zadane parametry wyjściowe.

Rozwiązanie to często stosowane jest w stacjach zmiękczania w budynkach wielorodzinnych i hotelach. Główną zaletą tego systemu jest pełna kontrola nad momentem regeneracji złoża, ponieważ regeneracja czasowa pozwala na dokładne zaplanowanie przestoju urządzenia. W systemach jednokolumnowych regeneracja wiąże się z przerwą w uzdatnianiu. Zaprogramowanie regeneracji na godziny nocne zapobiega podawaniu twardej wody podczas szczytowego zużycia w ciągu dnia. Jest to rozwiązanie dla obiektów wielorodzinnych, ponieważ krótkotrwały i nieznaczny spadek jakości wody, np. porą nocną, podczas zaplanowanego płukania nie wpływa negatywnie na ogólną eksploatację instalacji.

Innym rodzajem jest regeneracja objętościowa.