Analiza ryzyka to jeden z etapów oceny ryzyka. Polega ona na systematycznym badaniu i opisie stanu bezpieczeństwa systemu wodnego. Proces ten obejmuje przede wszystkim wskazanie konkretnych zagrożeń, które mogą mieć potencjalnie szkodliwy wpływ jakość wody. W ramach analizy ryzyka definiuje się również zdarzenia niebezpieczne.

Analiza kończy się oceną, jak bardzo prawdopodobne są zagrożenia, które wykryto, i jak poważnie mogą wpłynąć na zdrowie ludzi. Pozwala to na uzyskanie danych do stworzenia macierzy ryzyka i ustalenia, które zagrożenia wymagają szczególnej uwagi oraz podjęcia działań zapewniających bezpieczeństwo wodne.