Monitoring operacyjny to plan badań wody ustalany przez dostawcę lub zarządcę nieruchomości. Zapewnia on szybki wgląd w parametry technologiczne i jakość wody. Jego celem jest natychmiastowe podjęcie działań naprawczych oraz potwierdzenie skuteczności wszystkich środków zapewniających prawidłową jakość wody.

W przeciwieństwie do monitoringu zgodności, który jest reaktywny (badania wody, która już dotarła do konsumenta), monitoring operacyjny służy zapobieganiu utracie kontroli nad procesem. Powinien on obejmować parametry wskazujące na awarię lub spadek wydajności barier, zanim problem dotrze do odbiorcy.

Każdy monitorowany parametr jakości wody musi mieć zdefiniowane dopuszczalne wartości. Przekroczenie ich powinno skutkować wdrożeniem procedur naprawczych w celu utrzymania ciągłości dostaw i zapewnienia bezpieczeństwa wody.